Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeleQ00690 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms