Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlkP97793 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlkP97793 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlkP97793 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlkP97793 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlkP97793 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlkP97793 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlkP97793 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlkP97793 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlkP97793 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlkP97793 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlkP97793 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms