Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cry1P97784 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cry1P97784 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cry1P97784 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cry1P97784 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cry1P97784 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.9 ms