Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
rp9P97762 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
rp9P97762 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms