Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig3P97386 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms