Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme1P97371 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms