Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms