Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad1P70340 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms