Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb13P70321 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms