Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux2P70298 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cux2P70298 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux2P70298 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux2P70298 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux2P70298 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux2P70298 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms