Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sycp3P70281 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms