Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snrpd3P62320 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snrpd3P62320 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms