Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PlnP61014 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PlnP61014 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PlnP61014 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PlnP61014 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PlnP61014 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PlnP61014 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PlnP61014 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PlnP61014 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms