Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcbp1P60335 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms