Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Paxbp1P58501 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Paxbp1P58501 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms