Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1P56183 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms