Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb4P54761 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb4P54761 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms