Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ephb3P54754 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb3P54754 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms