Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacnb3P54285 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacnb3P54285 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms