Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms