Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Map3k1P53349 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map3k1P53349 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms