Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upp1P52624 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upp1P52624 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms