Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a1P51906 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a1P51906 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms