Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Tmod1P49813 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Tmod1P49813 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Tmod1P49813 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Tmod1P49813 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmod1P49813 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmod1P49813 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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