Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbp3P49194 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms