Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LmnaP48678 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms