Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 720.5 ms