Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtlP38585 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtlP38585 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms