Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddit3P35639 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms