Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin1P35438 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grin1P35438 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms