Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn11P35235 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms