Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcdP28867 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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