Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprmP28828 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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