Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms