Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms