Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RhoP15409 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RhoP15409 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RhoP15409 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RhoP15409 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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