Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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