Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Myod1P10085 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms