Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Schip1P0DPB4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Schip1P0DPB4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms