Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Col4a2P08122 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a2P08122 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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