Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mtnd1P03888 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms