Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd160O88875 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cd160O88875 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd160O88875 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cd160O88875 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms