Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
JtbO88824 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
JtbO88824 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
JtbO88824 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
JtbO88824 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms