Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shoc2O88520 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms