Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nme6O88425 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nme6O88425 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms