Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AvilO88398 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AvilO88398 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms