Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f6O54917 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms