Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phox2bO35690 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms