Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2O35245 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2O35245 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms