Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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